Oddział Instytutu Pamięci Narodowej w Poznaniu powstał w 2000 r., a jego pierwsza siedziba znajdowała się w pomieszczeniach Aresztu Śledczego w Poznaniu przy ul. Młyńskiej 1.
Następnie w roku 2001 oddział przeniósł się do jednej z kamienic na Placu Wolności. W dzień upamiętnienia robotniczego protestu z Czerwca 1956 r. 28 czerwca 2002 r. nastąpiło uroczyste otwarcie nowej siedziby Instytutu Pamięci Narodowej Oddział w Poznaniu, która od tego momentu nieprzerwanie znajduje się przy ul. Rolnej 45a w Poznaniu.